Peruskoulun yhdeksäsluokkalaiset voivat hakea Etelä- Pohjanmaan urheiluakatemiaan Lapualla, Seinäjoella ja Kuortaneella. Yläkoululaiset ovat mukana toisen asteen valmennusryhmissä ja valinnoissa noudatetaan 2. asteen valintakriteerejä.

Kaikki yläkoululaiset (seuraavan lukuvuoden 9-luokkalaiset) hakevat akatemiaan vuosittain helmikuun loppuun mennessä.

Yläkoululaiset saavat tiedot valinnoistaan maaliskuun loppuun mennessä, paitsi niissä lajeissa, joissa hakijoille järjestetään lajiliittopisteytystapahtumia (pesäpallo, salibandy ja kestävyysurheilu).